Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Epha6Q62413 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Epha6Q62413 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms