Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SypQ62277 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SypQ62277 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SypQ62277 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SypQ62277 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SypQ62277 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SypQ62277 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SypQ62277 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SypQ62277 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SypQ62277 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms