Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prkd1Q62101 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 996.8 ms