Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pcbp2Q61990 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pcbp2Q61990 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms