Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prg2Q61878 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Prg2Q61878 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms