Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gli3Q61602 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gli3Q61602 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms