Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rad21Q61550 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rad21Q61550 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms