Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcd2Q61285 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms