Protein–RNA interactions for Protein: Q61241

Tssk1b, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssk1bQ61241 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Tssk1bQ61241 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tssk1bQ61241 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms