Protein–RNA interactions for Protein: Q61164

Ctcf, Transcriptional repressor CTCF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcfQ61164 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CtcfQ61164 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CtcfQ61164 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms