Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Foxd3Q61060 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms