Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
JrkQ60976 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JrkQ60976 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JrkQ60976 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms