Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Grik1Q60934 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Grik1Q60934 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms