Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atf3Q60765 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atf3Q60765 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms