Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Csnk2a1Q60737 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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