Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tcf4Q60722 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms