Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Samhd1Q60710 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms