Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SkiQ60698 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SkiQ60698 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SkiQ60698 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms