Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ClpbQ60649 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ClpbQ60649 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms