Protein–RNA interactions for Protein: Q5UW37

Cxcl17, C-X-C motif chemokine 17, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl17Q5UW37 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Cxcl17Q5UW37 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Cxcl17Q5UW37 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Cxcl17Q5UW37 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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Cxcl17Q5UW37 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cxcl17Q5UW37 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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