Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc125Q5U465 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc125Q5U465 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms