Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Brip1Q5SXJ3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Brip1Q5SXJ3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms