Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vmn1r196Q5SVD5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r196Q5SVD5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms