Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD0

Rflnb, Refilin-B, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RflnbQ5SVD0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RflnbQ5SVD0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms