Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TefmQ5SSK3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TefmQ5SSK3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms