Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf215Q5SPX3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms