Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Trappc1Q5NCF2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trappc1Q5NCF2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms