Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trim58Q5NCC9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trim58Q5NCC9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms