Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnni3kQ5GIG6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms