Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prkaa1Q5EG47 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prkaa1Q5EG47 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms