Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU05

Cep164, Centrosomal protein of 164 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep164Q5DU05 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cep164Q5DU05 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cep164Q5DU05 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cep164Q5DU05 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cep164Q5DU05 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Cep164Q5DU05 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cep164Q5DU05 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cep164Q5DU05 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cep164Q5DU05 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms