Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spire1Q52KF3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spire1Q52KF3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms