Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA53

Pds5b, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pds5bQ4VA53 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pds5bQ4VA53 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pds5bQ4VA53 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
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