Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc84Q4VA36 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc84Q4VA36 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms