Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trp53i11Q4QQM4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trp53i11Q4QQM4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms