Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx25Q3ZT31 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx25Q3ZT31 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms