Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ckap2Q3V1H1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2Q3V1H1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms