Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C1

Zmat1, Zinc finger matrin-type protein 1, mousemouse

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Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat1Q3V0C1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Zmat1Q3V0C1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Zmat1Q3V0C1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zmat1Q3V0C1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zmat1Q3V0C1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zmat1Q3V0C1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zmat1Q3V0C1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms