Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnpc3Q3UZ01 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms