Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fbQ3UWQ3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms