Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clpsl2Q3UW21 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clpsl2Q3UW21 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms