Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTB2

A630001G21Rik, RIKEN cDNA A630001G21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630001G21RikQ3UTB2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
A630001G21RikQ3UTB2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms