Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Znf48Q3US17 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Znf48Q3US17 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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