Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx21Q3UR97 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx21Q3UR97 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx21Q3UR97 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx21Q3UR97 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx21Q3UR97 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms