Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Skap2Q3UND0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms