Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lsg1Q3UM18 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms