Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pin1rt1Q3ULQ2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms