Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sf3b2Q3UJB0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sf3b2Q3UJB0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms