Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccser2Q3UHI0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms