Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pitpnm3Q3UHE1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms